噬菌體篩選的噬菌體（bacteriophage）是一類以細菌為寄主的病毒，故也稱為細菌病毒，分為溫和性與烈性噬菌體兩大類。在大多數的原核生物中都可以發現噬菌體的存在，目前已有近2900種（株）噬菌體可通過電鏡觀察到，其中大腸桿菌是深入研究的一種寄主。
噬菌體與傳統的抗生素治療方案相比，在臨床治療上具有更多潛在的優勢與價值，包括噬菌體具有高度的寄主特異性、復制能力、副作用極小和無殘留等特點。
噬菌體篩選在基因編輯上的應用：
近年來，隨著基因編輯，測序，分子生物學等技術的飛速發展，人們可以在遺傳學水平上對噬菌體進行全面的編輯、解析甚至是合成噬菌體，對噬菌體的了解不再是簡單的生化特性和形態觀察。目前，CRISPR-Cas，YAC和BRED等許多技術都可以實現噬菌體編輯。噬菌體宿主譜的擴展或改變可以通過改造遺傳學達成。
基因編輯還可以賦予噬菌體多種特性，包括控制裂解和復制的速度以便更好的控制細菌內毒素的釋放，和增強噬菌體在生物體內的生存能力。但是，由于各國對轉基因技術的態度不同。一些國家或地區，基因編輯噬菌體可能在監管途徑和醫學接受方面遇到一些挑戰，或者至少需要一些額外的數據支持。這也意味著它們的使用可能要遵守更嚴格的監管。
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